Text

UJI IN SILICO AKTIVITAS ANTI-ALZHEIMER SENYAWA RUTIN, ISORAMNETIN, DAN TRIFOLIN PADA DAUN MANGROVE (Rhizophora mucronata) SEBAGAI RAGE INHIBITOR

---

UJI IN SILICO AKTIVITAS ANTI-ALZHEIMER SENYAWA RUTIN,
ISORAMNETIN, DAN TRIFOLIN PADA DAUN MANGROVE (Rhizophora
mucronata) SEBAGAI RAGE INHIBITOR
Wulan Desi Rahmayanti
ABSTRAK
Penyakit Alzheimer merupakan gangguan neurodegeneratif progresif yang
ditandai oleh penurunan fungsi kognitif akibat akumulasi amiloid-?,
hiperfosforilasi tau, serta proses neuroinflamasi. Terapi yang tersedia saat ini hanya
bersifat simptomatik, sehingga diperlukan pendekatan baru dalam pengembangan
terapi Alzheimer. Penghambatan interaksi Receptor for Advanced Glycation End
Products (RAGE) dengan ligan-ligannya (A?, HMGB1, protein S100, AGEs)
menjadi strategi potensial karena dapat menekan proses neuroinflamasi yang
mempercepat progresivitas Alzheimer. Daun Rhizophora mucronata mengandung
flavonoid seperti kuersetin, kaemferol, rutin, isoramnetin, dan trifolin. Berdasarkan
studi in silico, kuersetin dan kaemferol diketahui memiliki potensi sebagai inhibitor
RAGE, sedangkan rutin, isoramnetin, dan trifolin belum dieksplorasi lebih lanjut.
Penelitian ini bertujuan mengevaluasi potensi ketiga senyawa tersebut sebagai agen
anti-Alzheimer melalui penghambatan RAGE (PDB ID: 6XQ3). Analisis dilakukan
secara in silico menggunakan AutoDock Tools 1.5.7 untuk molecular docking,
SwissADME untuk prediksi sifat fisikokimia dan profil ADME, serta ProTox 3.0
untuk prediksi toksisitas. Hasil analisis menunjukkan senyawa rutin, isoramnetin,
dan trifolin dari daun Rhizophora mucronata memiliki nilai energi ikat bebas
berturut-turut sebesar -7,32; -6,40; dan -6,08 kkal/mol, dengan konstanta inhibisi
masing-masing 4,34 ?M; 20,44 ?M; dan 34,65 ?M. Senyawa uji memiliki afinitas
pengikatan yang lebih baik dibandingkan ligan pembanding (azeliragon) dengan
energi ikat bebas -5,30 kkal/mol dan konstanta inhibisi 130,93 ?M. Hasil prediksi
sifat fisikokimia menunjukkan hanya senyawa isoramnetin yang memenuhi kriteria
Hukum 5 Lipinski. Prediksi ADME menunjukkan senyawa isoramnetin memiliki
profil farmakokinetik yang paling baik dari senyawa uji lainnya. Prediksi toksisitas
menunjukkan bahwa seluruh senyawa uji memiliki profil toksisitas akut yang relatif
rendah. Oleh karena itu, senyawa isoramnetin berpotensi untuk dikembangkan lebih
lanjut sebagai kandidat obat anti-Alzheimer melaui mekanisme penghambatan
RAGE.
Kata kunci: Daun Rhizophora mucronata, rutin, isoramnetin, trifolin, RAGE, in
silico, Alzheimerviii
IN SILICO TEST OF THE ANTI-ALZHEIMER?S ACTIVITY OF RUTIN,
ISORAMNETIN, AND TRIFOLIN FROM MANGROVE LEAVES
(Rhizophora mucronata) AS RAGE INHIBITORS
Wulan Desi Rahmayanti
ABSTRACT
Alzheimer?s disease is a progressive neurodegenerative disorder
characterized by cognitive decline associated with amyloid-? accumulation, tau
hyperphosphorylation, and neuroinflammatory processes. Current therapeutic
options are largely symptomatic, highlighting the need for new strategies in
developing Alzheimer?s therapy. Inhibiting the interaction between Receptor for
Advanced Glycation End Products (RAGE) and its ligands (A?, HMGB1, S100
proteins, and AGEs) represents a promising approach because this pathway
contributes to neuroinflammation wich accelerates disease progression. Rhizophora
mucronata contains several flavonoids, including quercetin, kaempferol, rutin,
isoramnetin, and trifolin. Previous in silico studies have shown that quercetin and
kaempferol possess potential as RAGE inhibitors, whereas rutin, isoramnetin, and
trifolin have not been extensively explored. This study aims to evaluate the potential
of those unexplored three compounds as anti-Alzheimer agents through RAGE
inhibition (PDB ID: 6XQ3). The analysis was conducted in silico using AutoDock
Tools 1.5.7 for molecular docking, SwissADME for physicochemical and ADME
predictions, and ProTox 3.0 for toxicity assessment. The analysis results showed
that rutin, isorhamnetin, and trifolin isolated from Rhizophora mucronata leaves
exhibited binding free energy values of ?7.32, ?6.40, and ?6.08 kcal/mol, with
inhibition constants of 4.34 ?M, 20.44 ?M, and 34.65 ?M, respectively. There
compounds demonstrated better binding affinity than the reference ligand
azeliragon, which showed a binding free energy of ?5.30 kcal/mol and an inhibition
constant of 130.93 ?M. Physicochemical property prediction indicated that only
isorhamnetin complied with all criteria of Lipinski?s Rule of Five. Furthermore,
ADME prediction revealed that isorhamnetin exhibited the most favorable
pharmacokinetic profile among the others. Toxicity prediction showed that all
tested compounds possessed relatively low acute toxicity. Therefore, isorhamnetin
may be considered a promising candidate for further development as an antiAlzheimer agent via inhibition of the RAGE pathway.
Keywords: Rhizophora mucronata, rutin, isoramnetin, trifolin, RAGE, in silico,
Alzheimer

---

Ketersediaan

Informasi Detail

Judul Seri

-

No. Panggil

440

Penerbit

Mataram : Farmasi FKIK Unram., 2026

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

DTS 610 Wul u F.2026

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

SKRIPSI 2026

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

-

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar