Text

STUDI PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA BIOAKTIF Caulerpa lentillifera SEBAGAI KANDIDAT ANTIAKNE MELALUI PENGHAMBATAN ENZIM Cutibacterium acnes LIPASE

---

Studi Penambatan Molekul Senyawa Bioaktif Caulerpa lentillifera
sebagai Kandidat Antiakne melalui Penghambatan Enzim
Cutibacterium Acnes Lipase
Febriana Putri Rohmayani
ABSTRAK
Acne vulgaris merupakan penyakit kulit inflamasi kronis yang banyak dialami
remaja di seluruh dunia. Penggunaan antibiotik sebagai terapi utama sering
menimbulkan resistensi, sehingga diperlukan alternatif berbasis bahan alam dengan
risiko resistensi yang lebih rendah. Caulerpa lentillifera merupakan alga hijau yang
kaya senyawa bioaktif seperti flavonoid, fenolik, dan asam lemak. Senyawasenyawa ini diketahui memiliki aktivitas antibakteri dan berpotensi sebagai
antiakne. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi potensi senyawa bioaktif
Caulerpa lentillifera sebagai agen antiakne melalui penghambatan enzim
Cutibacterium acnes lipase (PDB ID: 6KHM). Analisis dilakukan secara in silico
menggunakan aplikasi YASARA Structure dengan pendekatan fungsi penilaian
force-field dan tipe penambatan flexible?rigid docking untuk mengevaluasi
interaksi ligan-reseptor. Evaluasi sifat fisikokimia dilakukan menggunakan
SwissADME, sedangkan prediksi profil ADMET dianalisis melalui pkCSM. Hasil
yang diperoleh adalah beberapa senyawa bioaktif Caulerpa lentillifera memiliki
afinitas pengikatan yang baik terhadap enzim Cutibacterium acnes lipase dengan 3
senyawa terbaik yaitu 2-(1H-indol-3-yl)-3-[4-(trifluoromethyl)phenyl]
acrylonitrile, isokuersetin, dan jubanin C. Analisis sifat fisikokimia menunjukkan
bahwa 2-(1H-indol-3-yl)-3-[4-(trifluoromethyl)phenyl]acrylonitrile memenuhi
kriteria kelayakan obat secara oral dengan parameter: berat molekul 316,32 Da;
refraktivitas molar 89,35; jumlah rotatable bond 4; log P 2,51; hydrogen bond
donor 2; hydrogen bond acceptor 4; serta topological polar surface area 35,88 Ų.
Sementara itu, berdasarkan prediksi ADMET, isokuersetin menunjukkan profil
keamanan yang relatif lebih baik dibandingkan kandidat senyawa lainnya.
Kata Kunci: Acne vulgaris; Caulerpa lentillifera; Cutibacterium acnes lipase,
Penambatan molekul.viii
Molecular Docking Evaluation of Bioactive Compounds from Caulerpa
lentillifera as Potential Anti-Acne Agents Targeting Cutibacterium acnes
Lipase
Febriana Putri Rohmayani
ABSTRACT
Acne vulgaris is a chronic inflammatory skin disease commonly experienced by
adolescents worldwide. The use of antibiotics as the main therapy often leads to
resistance, highlighting the need for alternative treatments based on natural
products with a lower risk of resistance. Caulerpa lentillifera is a green alga rich in
bioactive compounds such as flavonoids, phenolics, and fatty acids. These
compounds are known to possess antibacterial activity and potential anti-acne
properties. This study aimed to predict the potential of bioactive compounds from
Caulerpa lentillifera as anti-acne agents through inhibition of the Cutibacterium
acnes lipase enzyme (PDB ID: 6KHM). The analysis was conducted in silico using
YASARA Structure with a force-field?based scoring function and a flexible?rigid
docking approach to evaluate ligand-receptor interactions. Physicochemical
properties were assessed using SwissADME, while ADMET profiles were
predicted using pkCSM. The results showed that several bioactive compounds from
Caulerpa lentillifera exhibited good binding affinity toward Cutibacterium acnes
lipase, with three top candidates identified as 2-(1H-indol-3-yl)-3-[4-
(trifluoromethyl)phenyl]acrylonitrile, isoquercetin, and jubanine C.
Physicochemical predictions indicated that 2-(1H-indol-3-yl)-3-[4-
(trifluoromethyl)phenyl]acrylonitrile met the criteria for oral drug-likeness, with
the following parameters: molecular weight 316.32 Da; molar refractivity 89.35; 4
rotatable bonds; log P 2.51; 2 hydrogen bond donors; 4 hydrogen bond acceptors;
and a topological polar surface area of 35.88 Ų. Meanwhile, ADMET prediction
suggested that isoquercetin demonstrated a relatively better safety profile compared
to the other candidate compounds.
Keywords: Acne vulgaris; Caulerpa lentillifera; Cutibacterium acnes lipase;
Molecular docking

---

Ketersediaan

Informasi Detail

Judul Seri

-

No. Panggil

455

Penerbit

Mataram : Farmasi FKIK Unram., 2026

Deskripsi Fisik

-

Bahasa

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Klasifikasi

DTS 610 Feb s F.2026

Tipe Isi

-

Tipe Media

-

Tipe Pembawa

-

Edisi

-

Subjek

SKRIPSI 2026

Info Detail Spesifik

-

Pernyataan Tanggungjawab

-

Versi lain/terkait

Lampiran Berkas

Komentar

---

Anda harus masuk sebelum memberikan komentar